Die "Indexdateien" auf dem Mac sind Metadaten für die Spolightsuche. Kann man abschalten.
Direkt nach dem Formatieren Spotlight in den Systemeinstellungen aussuchen, ganz unten auf Datenschutz der Suchfunktion… klicken und das Laufwerk mit + hinzufügen. Die Einstellung ist dauerhaft bis zum nächsten Formatieren. Ohne extra Tools, ohne Kosten.
Man kann das ganze natürlich auch auf der Kommandozeile machen:
mdutil -i off /Volumes/StickName